Prevenção primária

Higienizar lentes de contato e evitar o uso de lentes por toda a noite são fatores fundamentais para evitar a ceratite. O uso de protetores oculares durante atividades perigosas e o atendimento médico imediato após um trauma ocular também são importantes.​[4]​​ Os fatores predisponentes, como olho seco, triquíase e erosões recorrentes devem ser tratados.

O rastreamento pré-natal é usado para se prevenir a ceratite neonatal (por vírus do herpes simples, gonocócica etc.).

Prevenção secundária

Na ceratite herpética recorrente, pode-se usar medicação antiviral profilática, como o aciclovir, para reduzir o número de episódios, especialmente em pacientes submetidos a cirurgias de transplante de córnea.[7][40]​​[64]

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